副本是玩家获取资源、装备和提升战斗熟练度的重要途径。副本主要分布在特定地图或通过任务触发进入，例如密斯卡大学、山脚据点、秘密起点等。这些副本通常需要达到一定等级或完成前置任务才能解锁，部分副本还要求组队挑战以提高通关效率。密斯卡大学副本位于大学地图内，进入前需确保角色等级达标并组建协作能力较强的队伍；山脚据点副本则需携带狙击枪或喷火器等针对性武器应对特殊感染体；秘密起点副本位于地下车站，需利用盾牌机制破解漏水陷阱和地铁控制台谜题。
副本的挑战机制多样，通常包含区域探索、怪物群清理、BOSS战和机关解谜等环节。以山脚据点为例，玩家需先炸开洞口清理蜘蛛群，随后在洞穴深处击败核心感染体并获取钥匙；秘密起点副本则需团队配合展开盾牌阻挡漏水，同时分头启动水闸和地铁控制台。不同副本的怪物存在属性克制关系，例如燃烧属性克制孢子类怪物，电磁属性对晶化怪物效果显著，合理搭配武器属性和队伍职业是通关的关键。副本中还会设置弹药补给点和临时复活点，需充分利用这些资源点调整战术。
通关副本后的奖励包括异变核芯、专研材料、金条及装备配方等，部分稀有奖励可通过交易市场兑换资源。每日首次通关奖励最为丰厚，后续重复挑战需消耗奖励券。副本难度与采集等级挂钩，建议选择低于自身等级1-2阶的副本平衡效率与收益。危海寻晶等特殊副本还设有连击进度条，连击数越高则伤害加成越明显，但需注意落水会导致昏迷时间递增的惩罚机制。
退出副本的方式主要有两种：通关后自动传送至入口，或通过地图标记的飞机点/传送锚点手动返回。部分副本如黄沙戈壁可利用雷达快速传送到锚点位置，再通过海域锚点实现快速移动。若中途需要暂停，队伍全员需统一行动避免进度丢失。副本中死亡不会损失装备耐久，但会消耗随身医疗箱，建议提前准备足够的凝固剂和肾上腺素针剂。
对于新手玩家，建议优先完成生存手册引导的副本任务，逐步熟悉机制后再挑战高难度内容。职业选择上血清学家能提供稳定的团队增益，而装备方面优先购买市场成品而非自制，可节省资源消耗。副本攻略需结合实战经验灵活调整，多观察怪物攻击模式和地形特点，善用掩体和弹药箱维持持续输出能力。
